金融工程专业是一个设计金融、数学、计算机等专业的综合学科，不同学校的侧重点不同，所以该专业所属的学院也不同。
一般有商学院、数学系和工程学院，还有的大学是交叉学科，其学生可能选不同学院的课。
下设商学院的金融工程比如：
华盛顿大学
卡内基梅隆大学
加州大学洛杉矶分校
加州大学伯克利分校等
下设工程、数学等学院的金融工程：
密歇根大学的定量金融专业和普渡大学的计算机金融专业开在其数学系下
纽约大学的金融数学专业在设在其Courant数学科学研究所下
哥伦比亚大学的金融工程专业则开设在其工学院的IEOR系下
康奈尔大学的该专业开设在其运筹学与信息工程学院下
南加州大学是商学院、工学院和文学院组成的交叉学科
亚特兰大大学的学生则可以在工学院、数学系和管理学院中自由选择一个放自己的学籍
由于不同大学该专业属于不同的学院，侧重点不一样，甚至名称和学位也不一样，所以对学生的培养计划也不同，在课程设置上也会有区别。
核心课程基本就是
数学
统计学
金融模型
计算机
编程
比如哥伦比亚大学的金融工程专业课程更偏向工程，核心课程有金融工程入门数学、金融工程基础、优化模型与方法、随机模型、连续时间模型、蒙特 ·卡罗模拟、统计分析与时间序列等。
康奈尔大学该专业的核心课程更侧重金融债券和风险管理，密歇根大学的则更注重数学，将数学与金融相结合，有高级金融数学、计算金融等。
